Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF6P49848 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF6P49848 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF6P49848 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF6P49848 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF6P49848 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF6P49848 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF6P49848 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF6P49848 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF6P49848 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF6P49848 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF6P49848 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF6P49848 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF6P49848 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF6P49848 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF6P49848 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF6P49848 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF6P49848 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF6P49848 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF6P49848 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF6P49848 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF6P49848 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF6P49848 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF6P49848 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF6P49848 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF6P49848 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF6P49848 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF6P49848 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF6P49848 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF6P49848 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF6P49848 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF6P49848 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TAF6P49848 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
TAF6P49848 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TAF6P49848 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TAF6P49848 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TAF6P49848 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TAF6P49848 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TAF6P49848 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TAF6P49848 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TAF6P49848 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TAF6P49848 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TAF6P49848 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TAF6P49848 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TAF6P49848 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TAF6P49848 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TAF6P49848 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TAF6P49848 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TAF6P49848 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TAF6P49848 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TAF6P49848 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TAF6P49848 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TAF6P49848 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TAF6P49848 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TAF6P49848 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TAF6P49848 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TAF6P49848 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TAF6P49848 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TAF6P49848 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TAF6P49848 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF6P49848 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF6P49848 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF6P49848 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF6P49848 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF6P49848 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF6P49848 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF6P49848 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF6P49848 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF6P49848 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF6P49848 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF6P49848 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF6P49848 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF6P49848 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF6P49848 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF6P49848 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF6P49848 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF6P49848 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF6P49848 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF6P49848 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF6P49848 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF6P49848 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF6P49848 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF6P49848 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF6P49848 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF6P49848 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF6P49848 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF6P49848 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF6P49848 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF6P49848 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF6P49848 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF6P49848 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF6P49848 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF6P49848 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF6P49848 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF6P49848 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF6P49848 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF6P49848 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF6P49848 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF6P49848 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF6P49848 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms