Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP4P49662 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP4P49662 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP4P49662 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP4P49662 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP4P49662 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP4P49662 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP4P49662 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP4P49662 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP4P49662 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP4P49662 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP4P49662 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP4P49662 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP4P49662 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP4P49662 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP4P49662 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP4P49662 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP4P49662 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP4P49662 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP4P49662 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP4P49662 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP4P49662 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP4P49662 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP4P49662 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP4P49662 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP4P49662 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASP4P49662 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASP4P49662 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASP4P49662 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASP4P49662 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CASP4P49662 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CASP4P49662 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASP4P49662 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASP4P49662 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CASP4P49662 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASP4P49662 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASP4P49662 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASP4P49662 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASP4P49662 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASP4P49662 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CASP4P49662 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CASP4P49662 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASP4P49662 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CASP4P49662 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CASP4P49662 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASP4P49662 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CASP4P49662 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CASP4P49662 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CASP4P49662 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CASP4P49662 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASP4P49662 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASP4P49662 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASP4P49662 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CASP4P49662 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASP4P49662 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASP4P49662 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASP4P49662 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASP4P49662 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASP4P49662 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASP4P49662 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP4P49662 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP4P49662 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP4P49662 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP4P49662 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP4P49662 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP4P49662 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP4P49662 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP4P49662 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP4P49662 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP4P49662 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP4P49662 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP4P49662 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP4P49662 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP4P49662 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP4P49662 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP4P49662 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP4P49662 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP4P49662 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP4P49662 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP4P49662 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP4P49662 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP4P49662 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP4P49662 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP4P49662 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP4P49662 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP4P49662 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP4P49662 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP4P49662 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP4P49662 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP4P49662 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP4P49662 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP4P49662 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP4P49662 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP4P49662 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP4P49662 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP4P49662 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP4P49662 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP4P49662 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP4P49662 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP4P49662 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms