Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
FNTAP49354 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNTAP49354 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNTAP49354 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNTAP49354 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNTAP49354 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNTAP49354 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNTAP49354 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNTAP49354 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNTAP49354 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNTAP49354 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNTAP49354 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNTAP49354 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNTAP49354 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNTAP49354 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNTAP49354 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNTAP49354 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNTAP49354 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNTAP49354 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNTAP49354 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNTAP49354 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNTAP49354 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNTAP49354 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNTAP49354 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNTAP49354 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNTAP49354 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNTAP49354 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNTAP49354 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNTAP49354 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNTAP49354 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNTAP49354 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNTAP49354 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNTAP49354 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNTAP49354 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNTAP49354 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNTAP49354 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNTAP49354 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FNTAP49354 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNTAP49354 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNTAP49354 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FNTAP49354 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNTAP49354 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNTAP49354 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNTAP49354 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNTAP49354 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNTAP49354 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNTAP49354 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNTAP49354 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNTAP49354 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNTAP49354 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNTAP49354 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNTAP49354 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNTAP49354 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNTAP49354 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FNTAP49354 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNTAP49354 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNTAP49354 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNTAP49354 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNTAP49354 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNTAP49354 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FNTAP49354 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
FNTAP49354 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
FNTAP49354 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
FNTAP49354 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FNTAP49354 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FNTAP49354 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FNTAP49354 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FNTAP49354 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FNTAP49354 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FNTAP49354 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FNTAP49354 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FNTAP49354 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FNTAP49354 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FNTAP49354 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FNTAP49354 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FNTAP49354 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FNTAP49354 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FNTAP49354 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FNTAP49354 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FNTAP49354 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FNTAP49354 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FNTAP49354 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FNTAP49354 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FNTAP49354 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FNTAP49354 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FNTAP49354 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FNTAP49354 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FNTAP49354 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FNTAP49354 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FNTAP49354 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FNTAP49354 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FNTAP49354 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FNTAP49354 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FNTAP49354 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FNTAP49354 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNTAP49354 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNTAP49354 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNTAP49354 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNTAP49354 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNTAP49354 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms