Protein–RNA interactions for Protein: P48067

SLC6A9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A9P48067 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms