Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABRB2P47870 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms