Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPD2P43304 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPD2P43304 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPD2P43304 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPD2P43304 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPD2P43304 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPD2P43304 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPD2P43304 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPD2P43304 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPD2P43304 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPD2P43304 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPD2P43304 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPD2P43304 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPD2P43304 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPD2P43304 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPD2P43304 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPD2P43304 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPD2P43304 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPD2P43304 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPD2P43304 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPD2P43304 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPD2P43304 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPD2P43304 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPD2P43304 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPD2P43304 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPD2P43304 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPD2P43304 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPD2P43304 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPD2P43304 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPD2P43304 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPD2P43304 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPD2P43304 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPD2P43304 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPD2P43304 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPD2P43304 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPD2P43304 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPD2P43304 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GPD2P43304 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPD2P43304 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPD2P43304 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPD2P43304 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPD2P43304 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPD2P43304 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPD2P43304 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPD2P43304 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPD2P43304 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPD2P43304 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPD2P43304 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GPD2P43304 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPD2P43304 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPD2P43304 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPD2P43304 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPD2P43304 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPD2P43304 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPD2P43304 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPD2P43304 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPD2P43304 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPD2P43304 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPD2P43304 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPD2P43304 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPD2P43304 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPD2P43304 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPD2P43304 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GPD2P43304 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GPD2P43304 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPD2P43304 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPD2P43304 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPD2P43304 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPD2P43304 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPD2P43304 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPD2P43304 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPD2P43304 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPD2P43304 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPD2P43304 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPD2P43304 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPD2P43304 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GPD2P43304 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPD2P43304 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPD2P43304 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPD2P43304 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPD2P43304 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPD2P43304 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPD2P43304 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPD2P43304 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPD2P43304 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPD2P43304 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPD2P43304 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPD2P43304 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPD2P43304 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPD2P43304 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPD2P43304 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPD2P43304 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPD2P43304 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPD2P43304 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPD2P43304 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPD2P43304 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPD2P43304 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPD2P43304 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPD2P43304 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPD2P43304 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms