Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms