Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LTBRP36941 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LTBRP36941 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LTBRP36941 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LTBRP36941 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LTBRP36941 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LTBRP36941 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LTBRP36941 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LTBRP36941 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LTBRP36941 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LTBRP36941 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LTBRP36941 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LTBRP36941 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LTBRP36941 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LTBRP36941 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LTBRP36941 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LTBRP36941 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LTBRP36941 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LTBRP36941 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LTBRP36941 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LTBRP36941 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LTBRP36941 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LTBRP36941 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LTBRP36941 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LTBRP36941 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LTBRP36941 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LTBRP36941 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LTBRP36941 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LTBRP36941 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LTBRP36941 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LTBRP36941 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LTBRP36941 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LTBRP36941 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LTBRP36941 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LTBRP36941 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LTBRP36941 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LTBRP36941 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LTBRP36941 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LTBRP36941 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LTBRP36941 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LTBRP36941 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LTBRP36941 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LTBRP36941 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LTBRP36941 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LTBRP36941 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LTBRP36941 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LTBRP36941 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LTBRP36941 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LTBRP36941 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LTBRP36941 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LTBRP36941 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LTBRP36941 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LTBRP36941 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LTBRP36941 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LTBRP36941 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LTBRP36941 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LTBRP36941 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LTBRP36941 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LTBRP36941 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LTBRP36941 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LTBRP36941 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LTBRP36941 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LTBRP36941 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LTBRP36941 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LTBRP36941 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LTBRP36941 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LTBRP36941 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LTBRP36941 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LTBRP36941 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LTBRP36941 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LTBRP36941 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LTBRP36941 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LTBRP36941 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LTBRP36941 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LTBRP36941 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LTBRP36941 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LTBRP36941 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LTBRP36941 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LTBRP36941 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LTBRP36941 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LTBRP36941 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LTBRP36941 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LTBRP36941 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LTBRP36941 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LTBRP36941 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LTBRP36941 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LTBRP36941 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LTBRP36941 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LTBRP36941 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LTBRP36941 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LTBRP36941 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LTBRP36941 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LTBRP36941 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LTBRP36941 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LTBRP36941 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LTBRP36941 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LTBRP36941 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LTBRP36941 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LTBRP36941 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LTBRP36941 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms