Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms