Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms