Protein–RNA interactions for Protein: P32320

CDA, Cytidine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDAP32320 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDAP32320 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDAP32320 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDAP32320 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDAP32320 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDAP32320 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDAP32320 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDAP32320 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDAP32320 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDAP32320 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDAP32320 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDAP32320 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDAP32320 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDAP32320 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDAP32320 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDAP32320 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDAP32320 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDAP32320 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDAP32320 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDAP32320 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDAP32320 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDAP32320 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDAP32320 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDAP32320 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDAP32320 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDAP32320 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDAP32320 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDAP32320 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDAP32320 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDAP32320 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDAP32320 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDAP32320 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDAP32320 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDAP32320 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDAP32320 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDAP32320 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDAP32320 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDAP32320 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDAP32320 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDAP32320 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDAP32320 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDAP32320 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDAP32320 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDAP32320 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDAP32320 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDAP32320 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDAP32320 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDAP32320 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDAP32320 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDAP32320 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDAP32320 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDAP32320 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDAP32320 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDAP32320 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDAP32320 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDAP32320 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDAP32320 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDAP32320 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDAP32320 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDAP32320 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDAP32320 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDAP32320 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDAP32320 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDAP32320 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDAP32320 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDAP32320 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDAP32320 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDAP32320 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDAP32320 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDAP32320 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDAP32320 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDAP32320 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDAP32320 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDAP32320 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDAP32320 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDAP32320 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDAP32320 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDAP32320 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDAP32320 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDAP32320 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDAP32320 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDAP32320 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDAP32320 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDAP32320 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDAP32320 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDAP32320 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDAP32320 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDAP32320 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDAP32320 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDAP32320 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDAP32320 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDAP32320 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDAP32320 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDAP32320 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDAP32320 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDAP32320 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDAP32320 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDAP32320 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDAP32320 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDAP32320 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms