Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXC13P31276 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms