Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TSPOP30536 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TSPOP30536 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TSPOP30536 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TSPOP30536 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TSPOP30536 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TSPOP30536 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TSPOP30536 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TSPOP30536 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TSPOP30536 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TSPOP30536 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TSPOP30536 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TSPOP30536 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TSPOP30536 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TSPOP30536 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TSPOP30536 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TSPOP30536 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TSPOP30536 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TSPOP30536 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TSPOP30536 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TSPOP30536 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TSPOP30536 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TSPOP30536 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TSPOP30536 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TSPOP30536 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TSPOP30536 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TSPOP30536 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TSPOP30536 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TSPOP30536 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TSPOP30536 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TSPOP30536 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TSPOP30536 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TSPOP30536 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TSPOP30536 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TSPOP30536 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TSPOP30536 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TSPOP30536 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TSPOP30536 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TSPOP30536 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TSPOP30536 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TSPOP30536 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TSPOP30536 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TSPOP30536 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TSPOP30536 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TSPOP30536 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TSPOP30536 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TSPOP30536 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TSPOP30536 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TSPOP30536 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TSPOP30536 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TSPOP30536 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TSPOP30536 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TSPOP30536 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TSPOP30536 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TSPOP30536 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TSPOP30536 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TSPOP30536 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TSPOP30536 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TSPOP30536 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPOP30536 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPOP30536 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPOP30536 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPOP30536 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPOP30536 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPOP30536 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPOP30536 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPOP30536 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPOP30536 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPOP30536 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPOP30536 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPOP30536 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPOP30536 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPOP30536 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPOP30536 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPOP30536 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPOP30536 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPOP30536 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPOP30536 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPOP30536 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPOP30536 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPOP30536 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPOP30536 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPOP30536 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPOP30536 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPOP30536 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPOP30536 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPOP30536 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPOP30536 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPOP30536 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPOP30536 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPOP30536 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPOP30536 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPOP30536 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPOP30536 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPOP30536 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPOP30536 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPOP30536 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPOP30536 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPOP30536 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPOP30536 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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