Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms