Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP1P29466 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP1P29466 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP1P29466 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP1P29466 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP1P29466 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP1P29466 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP1P29466 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP1P29466 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP1P29466 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP1P29466 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP1P29466 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP1P29466 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP1P29466 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP1P29466 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP1P29466 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP1P29466 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP1P29466 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP1P29466 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP1P29466 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP1P29466 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP1P29466 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP1P29466 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP1P29466 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP1P29466 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP1P29466 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP1P29466 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP1P29466 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP1P29466 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP1P29466 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP1P29466 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP1P29466 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP1P29466 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP1P29466 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP1P29466 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP1P29466 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP1P29466 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP1P29466 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP1P29466 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP1P29466 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP1P29466 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP1P29466 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP1P29466 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP1P29466 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP1P29466 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP1P29466 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP1P29466 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP1P29466 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP1P29466 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP1P29466 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP1P29466 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP1P29466 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP1P29466 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP1P29466 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP1P29466 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP1P29466 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP1P29466 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP1P29466 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP1P29466 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP1P29466 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP1P29466 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP1P29466 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP1P29466 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP1P29466 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP1P29466 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP1P29466 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP1P29466 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP1P29466 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP1P29466 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP1P29466 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP1P29466 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP1P29466 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP1P29466 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP1P29466 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP1P29466 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP1P29466 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP1P29466 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP1P29466 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP1P29466 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP1P29466 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP1P29466 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP1P29466 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP1P29466 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP1P29466 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP1P29466 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP1P29466 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP1P29466 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP1P29466 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP1P29466 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP1P29466 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP1P29466 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP1P29466 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP1P29466 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP1P29466 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP1P29466 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP1P29466 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP1P29466 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CASP1P29466 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CASP1P29466 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CASP1P29466 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms