Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CD34P28906 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD34P28906 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CD34P28906 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD34P28906 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CD34P28906 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD34P28906 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD34P28906 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CD34P28906 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CD34P28906 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CD34P28906 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CD34P28906 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CD34P28906 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CD34P28906 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CD34P28906 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CD34P28906 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CD34P28906 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD34P28906 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD34P28906 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CD34P28906 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CD34P28906 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CD34P28906 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD34P28906 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CD34P28906 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CD34P28906 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CD34P28906 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CD34P28906 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CD34P28906 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CD34P28906 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CD34P28906 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD34P28906 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD34P28906 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CD34P28906 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD34P28906 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CD34P28906 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CD34P28906 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD34P28906 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD34P28906 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CD34P28906 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CD34P28906 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CD34P28906 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CD34P28906 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CD34P28906 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CD34P28906 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CD34P28906 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CD34P28906 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CD34P28906 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CD34P28906 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD34P28906 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CD34P28906 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CD34P28906 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD34P28906 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CD34P28906 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CD34P28906 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CD34P28906 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD34P28906 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CD34P28906 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD34P28906 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CD34P28906 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD34P28906 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CD34P28906 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CD34P28906 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CD34P28906 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CD34P28906 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD34P28906 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CD34P28906 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CD34P28906 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD34P28906 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CD34P28906 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CD34P28906 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD34P28906 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD34P28906 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CD34P28906 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CD34P28906 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CD34P28906 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CD34P28906 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD34P28906 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CD34P28906 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD34P28906 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD34P28906 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CD34P28906 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD34P28906 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD34P28906 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD34P28906 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD34P28906 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD34P28906 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD34P28906 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD34P28906 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD34P28906 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD34P28906 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD34P28906 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD34P28906 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD34P28906 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD34P28906 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD34P28906 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD34P28906 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CD34P28906 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CD34P28906 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD34P28906 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD34P28906 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms