Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRMP28827 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
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