Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB4P28070 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms