Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PLNP26678 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PLNP26678 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PLNP26678 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PLNP26678 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PLNP26678 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PLNP26678 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PLNP26678 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PLNP26678 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PLNP26678 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PLNP26678 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PLNP26678 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PLNP26678 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PLNP26678 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PLNP26678 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PLNP26678 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PLNP26678 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PLNP26678 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PLNP26678 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PLNP26678 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PLNP26678 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PLNP26678 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PLNP26678 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PLNP26678 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PLNP26678 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PLNP26678 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PLNP26678 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PLNP26678 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PLNP26678 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PLNP26678 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PLNP26678 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PLNP26678 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PLNP26678 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PLNP26678 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PLNP26678 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PLNP26678 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PLNP26678 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PLNP26678 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PLNP26678 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PLNP26678 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PLNP26678 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PLNP26678 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PLNP26678 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PLNP26678 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PLNP26678 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PLNP26678 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PLNP26678 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PLNP26678 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PLNP26678 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PLNP26678 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PLNP26678 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PLNP26678 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PLNP26678 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PLNP26678 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PLNP26678 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PLNP26678 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PLNP26678 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PLNP26678 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PLNP26678 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PLNP26678 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PLNP26678 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PLNP26678 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PLNP26678 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PLNP26678 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PLNP26678 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PLNP26678 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PLNP26678 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PLNP26678 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PLNP26678 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PLNP26678 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PLNP26678 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PLNP26678 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PLNP26678 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PLNP26678 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PLNP26678 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PLNP26678 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PLNP26678 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PLNP26678 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PLNP26678 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PLNP26678 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PLNP26678 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PLNP26678 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PLNP26678 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PLNP26678 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PLNP26678 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PLNP26678 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PLNP26678 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PLNP26678 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PLNP26678 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PLNP26678 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PLNP26678 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PLNP26678 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PLNP26678 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PLNP26678 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PLNP26678 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PLNP26678 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PLNP26678 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PLNP26678 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PLNP26678 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PLNP26678 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms