Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKACBP22694 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms