Protein–RNA interactions for Protein: P18846

ATF1, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF1P18846 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATF1P18846 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATF1P18846 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATF1P18846 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATF1P18846 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATF1P18846 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATF1P18846 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATF1P18846 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATF1P18846 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATF1P18846 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATF1P18846 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATF1P18846 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATF1P18846 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATF1P18846 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATF1P18846 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATF1P18846 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATF1P18846 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATF1P18846 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATF1P18846 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATF1P18846 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATF1P18846 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATF1P18846 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATF1P18846 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATF1P18846 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATF1P18846 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATF1P18846 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATF1P18846 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATF1P18846 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATF1P18846 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATF1P18846 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATF1P18846 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATF1P18846 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATF1P18846 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATF1P18846 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATF1P18846 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATF1P18846 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATF1P18846 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATF1P18846 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATF1P18846 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATF1P18846 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATF1P18846 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATF1P18846 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATF1P18846 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATF1P18846 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATF1P18846 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATF1P18846 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATF1P18846 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATF1P18846 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATF1P18846 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATF1P18846 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATF1P18846 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATF1P18846 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATF1P18846 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATF1P18846 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
ATF1P18846 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATF1P18846 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATF1P18846 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATF1P18846 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATF1P18846 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATF1P18846 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATF1P18846 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATF1P18846 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATF1P18846 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATF1P18846 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATF1P18846 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATF1P18846 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATF1P18846 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATF1P18846 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATF1P18846 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATF1P18846 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATF1P18846 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATF1P18846 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATF1P18846 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATF1P18846 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATF1P18846 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATF1P18846 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATF1P18846 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATF1P18846 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATF1P18846 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATF1P18846 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATF1P18846 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATF1P18846 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATF1P18846 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATF1P18846 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATF1P18846 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATF1P18846 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATF1P18846 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATF1P18846 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATF1P18846 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATF1P18846 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATF1P18846 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATF1P18846 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATF1P18846 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATF1P18846 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATF1P18846 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATF1P18846 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATF1P18846 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATF1P18846 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATF1P18846 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATF1P18846 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms