Protein–RNA interactions for Protein: P17036

ZNF3, Zinc finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3P17036 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF3P17036 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF3P17036 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms