Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms