Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NR2F1P10589 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms