Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.05■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms