Protein–RNA interactions for Protein: P05160

F13B, Coagulation factor XIII B chain, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13BP05160 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
F13BP05160 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
F13BP05160 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
F13BP05160 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
F13BP05160 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
F13BP05160 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
F13BP05160 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
F13BP05160 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
F13BP05160 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
F13BP05160 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
F13BP05160 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
F13BP05160 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
F13BP05160 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
F13BP05160 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
F13BP05160 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
F13BP05160 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
F13BP05160 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
F13BP05160 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
F13BP05160 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
F13BP05160 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
F13BP05160 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
F13BP05160 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
F13BP05160 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
F13BP05160 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
F13BP05160 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
F13BP05160 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
F13BP05160 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
F13BP05160 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
F13BP05160 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
F13BP05160 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
F13BP05160 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
F13BP05160 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
F13BP05160 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
F13BP05160 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
F13BP05160 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
F13BP05160 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
F13BP05160 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
F13BP05160 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
F13BP05160 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
F13BP05160 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
F13BP05160 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
F13BP05160 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
F13BP05160 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
F13BP05160 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
F13BP05160 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
F13BP05160 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
F13BP05160 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
F13BP05160 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
F13BP05160 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
F13BP05160 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
F13BP05160 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
F13BP05160 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
F13BP05160 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
F13BP05160 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
F13BP05160 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
F13BP05160 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
F13BP05160 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
F13BP05160 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
F13BP05160 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
F13BP05160 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
F13BP05160 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
F13BP05160 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
F13BP05160 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
F13BP05160 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
F13BP05160 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
F13BP05160 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
F13BP05160 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
F13BP05160 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
F13BP05160 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
F13BP05160 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
F13BP05160 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
F13BP05160 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
F13BP05160 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
F13BP05160 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
F13BP05160 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
F13BP05160 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
F13BP05160 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
F13BP05160 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
F13BP05160 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
F13BP05160 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
F13BP05160 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
F13BP05160 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
F13BP05160 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
F13BP05160 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
F13BP05160 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
F13BP05160 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
F13BP05160 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
F13BP05160 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
F13BP05160 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
F13BP05160 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
F13BP05160 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
F13BP05160 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
F13BP05160 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
F13BP05160 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
F13BP05160 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
F13BP05160 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
F13BP05160 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
F13BP05160 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
F13BP05160 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
F13BP05160 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms