Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX4O95219 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX4O95219 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX4O95219 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX4O95219 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX4O95219 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX4O95219 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX4O95219 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX4O95219 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX4O95219 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX4O95219 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX4O95219 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX4O95219 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX4O95219 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX4O95219 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX4O95219 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX4O95219 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX4O95219 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX4O95219 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX4O95219 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX4O95219 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX4O95219 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX4O95219 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX4O95219 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX4O95219 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX4O95219 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX4O95219 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX4O95219 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX4O95219 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX4O95219 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX4O95219 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX4O95219 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX4O95219 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX4O95219 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX4O95219 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX4O95219 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX4O95219 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX4O95219 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX4O95219 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX4O95219 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX4O95219 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX4O95219 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX4O95219 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX4O95219 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX4O95219 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX4O95219 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX4O95219 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX4O95219 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX4O95219 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX4O95219 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX4O95219 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX4O95219 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX4O95219 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX4O95219 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX4O95219 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX4O95219 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX4O95219 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX4O95219 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX4O95219 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX4O95219 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX4O95219 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX4O95219 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX4O95219 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX4O95219 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX4O95219 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX4O95219 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX4O95219 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX4O95219 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX4O95219 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX4O95219 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX4O95219 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX4O95219 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX4O95219 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX4O95219 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX4O95219 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX4O95219 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX4O95219 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX4O95219 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX4O95219 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX4O95219 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX4O95219 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX4O95219 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX4O95219 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX4O95219 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX4O95219 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX4O95219 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX4O95219 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX4O95219 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX4O95219 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX4O95219 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX4O95219 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX4O95219 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX4O95219 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX4O95219 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX4O95219 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX4O95219 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX4O95219 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX4O95219 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX4O95219 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX4O95219 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms