Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NEBLO76041 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEBLO76041 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEBLO76041 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEBLO76041 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEBLO76041 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEBLO76041 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEBLO76041 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEBLO76041 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEBLO76041 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEBLO76041 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEBLO76041 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEBLO76041 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEBLO76041 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEBLO76041 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEBLO76041 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEBLO76041 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NEBLO76041 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEBLO76041 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEBLO76041 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEBLO76041 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEBLO76041 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEBLO76041 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEBLO76041 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEBLO76041 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEBLO76041 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEBLO76041 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEBLO76041 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEBLO76041 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEBLO76041 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEBLO76041 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEBLO76041 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEBLO76041 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEBLO76041 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEBLO76041 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEBLO76041 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEBLO76041 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEBLO76041 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEBLO76041 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEBLO76041 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEBLO76041 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEBLO76041 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEBLO76041 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEBLO76041 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEBLO76041 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NEBLO76041 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEBLO76041 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEBLO76041 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEBLO76041 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEBLO76041 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEBLO76041 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEBLO76041 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEBLO76041 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEBLO76041 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NEBLO76041 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEBLO76041 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEBLO76041 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEBLO76041 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEBLO76041 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEBLO76041 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEBLO76041 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEBLO76041 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEBLO76041 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEBLO76041 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEBLO76041 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEBLO76041 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NEBLO76041 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEBLO76041 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEBLO76041 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEBLO76041 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEBLO76041 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NEBLO76041 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEBLO76041 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEBLO76041 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEBLO76041 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEBLO76041 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NEBLO76041 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEBLO76041 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEBLO76041 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEBLO76041 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEBLO76041 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEBLO76041 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEBLO76041 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEBLO76041 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEBLO76041 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NEBLO76041 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NEBLO76041 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEBLO76041 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEBLO76041 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEBLO76041 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEBLO76041 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEBLO76041 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEBLO76041 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEBLO76041 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEBLO76041 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEBLO76041 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEBLO76041 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEBLO76041 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEBLO76041 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEBLO76041 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms