Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRPF3O43395 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms