Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BCKDKO14874 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BCKDKO14874 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BCKDKO14874 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BCKDKO14874 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BCKDKO14874 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BCKDKO14874 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BCKDKO14874 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BCKDKO14874 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BCKDKO14874 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BCKDKO14874 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BCKDKO14874 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BCKDKO14874 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BCKDKO14874 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BCKDKO14874 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BCKDKO14874 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BCKDKO14874 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BCKDKO14874 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BCKDKO14874 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BCKDKO14874 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BCKDKO14874 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BCKDKO14874 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BCKDKO14874 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BCKDKO14874 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BCKDKO14874 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BCKDKO14874 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BCKDKO14874 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BCKDKO14874 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BCKDKO14874 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BCKDKO14874 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BCKDKO14874 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BCKDKO14874 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BCKDKO14874 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BCKDKO14874 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BCKDKO14874 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BCKDKO14874 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BCKDKO14874 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BCKDKO14874 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BCKDKO14874 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BCKDKO14874 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BCKDKO14874 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BCKDKO14874 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BCKDKO14874 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BCKDKO14874 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BCKDKO14874 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BCKDKO14874 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BCKDKO14874 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BCKDKO14874 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BCKDKO14874 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BCKDKO14874 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BCKDKO14874 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BCKDKO14874 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BCKDKO14874 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BCKDKO14874 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BCKDKO14874 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BCKDKO14874 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BCKDKO14874 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BCKDKO14874 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BCKDKO14874 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BCKDKO14874 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BCKDKO14874 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BCKDKO14874 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BCKDKO14874 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BCKDKO14874 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BCKDKO14874 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BCKDKO14874 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BCKDKO14874 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms