Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTDSP2O14595 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms