Protein–RNA interactions for Protein: O00472

ELL2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL2O00472 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ELL2O00472 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ELL2O00472 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ELL2O00472 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ELL2O00472 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ELL2O00472 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ELL2O00472 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ELL2O00472 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ELL2O00472 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ELL2O00472 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ELL2O00472 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ELL2O00472 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ELL2O00472 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ELL2O00472 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ELL2O00472 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ELL2O00472 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ELL2O00472 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ELL2O00472 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ELL2O00472 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ELL2O00472 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ELL2O00472 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ELL2O00472 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ELL2O00472 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ELL2O00472 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ELL2O00472 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ELL2O00472 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ELL2O00472 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ELL2O00472 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ELL2O00472 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ELL2O00472 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ELL2O00472 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ELL2O00472 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ELL2O00472 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ELL2O00472 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ELL2O00472 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ELL2O00472 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ELL2O00472 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ELL2O00472 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ELL2O00472 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ELL2O00472 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ELL2O00472 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ELL2O00472 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ELL2O00472 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ELL2O00472 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ELL2O00472 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ELL2O00472 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ELL2O00472 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ELL2O00472 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ELL2O00472 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ELL2O00472 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ELL2O00472 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ELL2O00472 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ELL2O00472 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ELL2O00472 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ELL2O00472 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ELL2O00472 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ELL2O00472 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ELL2O00472 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ELL2O00472 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ELL2O00472 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ELL2O00472 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ELL2O00472 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ELL2O00472 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ELL2O00472 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ELL2O00472 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ELL2O00472 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ELL2O00472 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ELL2O00472 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ELL2O00472 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ELL2O00472 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ELL2O00472 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ELL2O00472 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ELL2O00472 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ELL2O00472 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ELL2O00472 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ELL2O00472 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ELL2O00472 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ELL2O00472 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ELL2O00472 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ELL2O00472 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ELL2O00472 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ELL2O00472 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ELL2O00472 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ELL2O00472 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ELL2O00472 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ELL2O00472 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ELL2O00472 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ELL2O00472 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ELL2O00472 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ELL2O00472 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ELL2O00472 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ELL2O00472 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ELL2O00472 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ELL2O00472 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ELL2O00472 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ELL2O00472 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ELL2O00472 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ELL2O00472 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ELL2O00472 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ELL2O00472 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms