Protein–RNA interactions for Protein: C9JLW8

MCRIP1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1C9JLW8 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MCRIP1C9JLW8 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms