Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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