Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms