Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

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Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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