Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC160A6NGH7 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC160A6NGH7 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms