Protein–RNA interactions for Protein: A4QMS7

C5orf49, Uncharacterized protein C5orf49, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf49A4QMS7 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C5orf49A4QMS7 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C5orf49A4QMS7 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C5orf49A4QMS7 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C5orf49A4QMS7 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C5orf49A4QMS7 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C5orf49A4QMS7 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C5orf49A4QMS7 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C5orf49A4QMS7 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C5orf49A4QMS7 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C5orf49A4QMS7 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C5orf49A4QMS7 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C5orf49A4QMS7 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C5orf49A4QMS7 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C5orf49A4QMS7 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C5orf49A4QMS7 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C5orf49A4QMS7 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C5orf49A4QMS7 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C5orf49A4QMS7 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C5orf49A4QMS7 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
C5orf49A4QMS7 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C5orf49A4QMS7 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
C5orf49A4QMS7 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C5orf49A4QMS7 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
C5orf49A4QMS7 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C5orf49A4QMS7 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C5orf49A4QMS7 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C5orf49A4QMS7 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C5orf49A4QMS7 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C5orf49A4QMS7 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C5orf49A4QMS7 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C5orf49A4QMS7 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C5orf49A4QMS7 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C5orf49A4QMS7 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C5orf49A4QMS7 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms