Protein–RNA interactions for Protein: A4FU01

MTMR11, Myotubularin-related protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR11A4FU01 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTMR11A4FU01 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTMR11A4FU01 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR11A4FU01 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR11A4FU01 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR11A4FU01 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR11A4FU01 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR11A4FU01 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR11A4FU01 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR11A4FU01 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR11A4FU01 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR11A4FU01 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR11A4FU01 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR11A4FU01 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR11A4FU01 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR11A4FU01 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR11A4FU01 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR11A4FU01 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR11A4FU01 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR11A4FU01 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR11A4FU01 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR11A4FU01 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR11A4FU01 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR11A4FU01 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR11A4FU01 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR11A4FU01 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR11A4FU01 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR11A4FU01 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR11A4FU01 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR11A4FU01 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR11A4FU01 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
MTMR11A4FU01 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR11A4FU01 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR11A4FU01 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR11A4FU01 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR11A4FU01 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR11A4FU01 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR11A4FU01 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR11A4FU01 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR11A4FU01 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR11A4FU01 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR11A4FU01 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR11A4FU01 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR11A4FU01 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR11A4FU01 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR11A4FU01 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR11A4FU01 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR11A4FU01 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR11A4FU01 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR11A4FU01 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR11A4FU01 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR11A4FU01 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR11A4FU01 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR11A4FU01 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR11A4FU01 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR11A4FU01 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR11A4FU01 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR11A4FU01 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR11A4FU01 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR11A4FU01 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR11A4FU01 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR11A4FU01 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR11A4FU01 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR11A4FU01 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR11A4FU01 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR11A4FU01 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR11A4FU01 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR11A4FU01 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR11A4FU01 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR11A4FU01 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR11A4FU01 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR11A4FU01 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR11A4FU01 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR11A4FU01 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR11A4FU01 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR11A4FU01 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR11A4FU01 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR11A4FU01 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR11A4FU01 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR11A4FU01 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR11A4FU01 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR11A4FU01 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR11A4FU01 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR11A4FU01 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR11A4FU01 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR11A4FU01 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR11A4FU01 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR11A4FU01 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR11A4FU01 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR11A4FU01 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR11A4FU01 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR11A4FU01 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR11A4FU01 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR11A4FU01 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR11A4FU01 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR11A4FU01 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR11A4FU01 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR11A4FU01 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR11A4FU01 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTMR11A4FU01 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms