Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ARL2-SNX15V9GYD0 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ARL2-SNX15V9GYD0 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms