Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PLXND1Q9Y4D7 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLXND1Q9Y4D7 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLXND1Q9Y4D7 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLXND1Q9Y4D7 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLXND1Q9Y4D7 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLXND1Q9Y4D7 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLXND1Q9Y4D7 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PLXND1Q9Y4D7 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLXND1Q9Y4D7 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PLXND1Q9Y4D7 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PLXND1Q9Y4D7 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLXND1Q9Y4D7 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLXND1Q9Y4D7 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLXND1Q9Y4D7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLXND1Q9Y4D7 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLXND1Q9Y4D7 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLXND1Q9Y4D7 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLXND1Q9Y4D7 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLXND1Q9Y4D7 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLXND1Q9Y4D7 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLXND1Q9Y4D7 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLXND1Q9Y4D7 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLXND1Q9Y4D7 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLXND1Q9Y4D7 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLXND1Q9Y4D7 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLXND1Q9Y4D7 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLXND1Q9Y4D7 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLXND1Q9Y4D7 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLXND1Q9Y4D7 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLXND1Q9Y4D7 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PLXND1Q9Y4D7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLXND1Q9Y4D7 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PLXND1Q9Y4D7 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLXND1Q9Y4D7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLXND1Q9Y4D7 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLXND1Q9Y4D7 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLXND1Q9Y4D7 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLXND1Q9Y4D7 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLXND1Q9Y4D7 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLXND1Q9Y4D7 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLXND1Q9Y4D7 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLXND1Q9Y4D7 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PLXND1Q9Y4D7 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PLXND1Q9Y4D7 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PLXND1Q9Y4D7 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PLXND1Q9Y4D7 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PLXND1Q9Y4D7 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PLXND1Q9Y4D7 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PLXND1Q9Y4D7 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PLXND1Q9Y4D7 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PLXND1Q9Y4D7 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PLXND1Q9Y4D7 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PLXND1Q9Y4D7 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PLXND1Q9Y4D7 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PLXND1Q9Y4D7 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PLXND1Q9Y4D7 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PLXND1Q9Y4D7 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PLXND1Q9Y4D7 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PLXND1Q9Y4D7 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PLXND1Q9Y4D7 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PLXND1Q9Y4D7 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PLXND1Q9Y4D7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PLXND1Q9Y4D7 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PLXND1Q9Y4D7 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PLXND1Q9Y4D7 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PLXND1Q9Y4D7 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
PLXND1Q9Y4D7 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PLXND1Q9Y4D7 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PLXND1Q9Y4D7 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PLXND1Q9Y4D7 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PLXND1Q9Y4D7 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PLXND1Q9Y4D7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PLXND1Q9Y4D7 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PLXND1Q9Y4D7 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PLXND1Q9Y4D7 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PLXND1Q9Y4D7 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLXND1Q9Y4D7 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLXND1Q9Y4D7 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLXND1Q9Y4D7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLXND1Q9Y4D7 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLXND1Q9Y4D7 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLXND1Q9Y4D7 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLXND1Q9Y4D7 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLXND1Q9Y4D7 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLXND1Q9Y4D7 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLXND1Q9Y4D7 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLXND1Q9Y4D7 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PLXND1Q9Y4D7 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLXND1Q9Y4D7 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLXND1Q9Y4D7 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLXND1Q9Y4D7 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLXND1Q9Y4D7 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PLXND1Q9Y4D7 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLXND1Q9Y4D7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLXND1Q9Y4D7 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLXND1Q9Y4D7 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLXND1Q9Y4D7 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PLXND1Q9Y4D7 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLXND1Q9Y4D7 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms