Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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SH3BP1Q9Y3L3 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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SH3BP1Q9Y3L3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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SH3BP1Q9Y3L3 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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SH3BP1Q9Y3L3 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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