Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms