Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IGSF9BQ9UPX0 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
IGSF9BQ9UPX0 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
IGSF9BQ9UPX0 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
IGSF9BQ9UPX0 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IGSF9BQ9UPX0 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IGSF9BQ9UPX0 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IGSF9BQ9UPX0 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
IGSF9BQ9UPX0 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
IGSF9BQ9UPX0 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
IGSF9BQ9UPX0 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IGSF9BQ9UPX0 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
IGSF9BQ9UPX0 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms