Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNRF3Q9ULT6 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms