Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BRPF3Q9ULD4 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRPF3Q9ULD4 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms