Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms