Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHORDC1Q9UHD1 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms