Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNMT3BQ9UBC3 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNMT3BQ9UBC3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNMT3BQ9UBC3 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNMT3BQ9UBC3 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNMT3BQ9UBC3 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNMT3BQ9UBC3 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DNMT3BQ9UBC3 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DNMT3BQ9UBC3 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DNMT3BQ9UBC3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DNMT3BQ9UBC3 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
DNMT3BQ9UBC3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DNMT3BQ9UBC3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
DNMT3BQ9UBC3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
DNMT3BQ9UBC3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNMT3BQ9UBC3 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms