Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms